Головний центр Служби єдиного часу і еталонних частот створена згідно з Законом України «Про метрологію та метрологічну діяльність» (розділ 2 стаття 9) [Докладніше]. Діяльність регулюється «Положенням про Службу єдиного часу і еталонних частот», затвердженим Постановою Кабінету Міністрів України від 2.09.2015 № 664.

1) Структурний підрозділ Національного наукового центру “Інститут метрології”, що належить до сфери управління Мінекономрозвитку - Головний центр Служби єдиного часу і еталонних частот;

2) структурний підрозділ державного підприємства “Всеукраїнський державний науково-виробничий центр стандартизації, метрології, сертифікації та захисту прав споживачів”, що належить до сфери управління Мінекономрозвитку;

3) структурний підрозділ Метрологічного центру військових еталонів Збройних Сил України Міноборони;

4) структурний підрозділ Головної астрономічної обсерваторії Національної академії наук;

5) структурні підрозділи підприємств, установ та організацій, що належать до сфери управління Адміністрації Держспецзв’язку і забезпечують передавання еталонних сигналів різними каналами зв’язку;

6) структурні підрозділи підприємств, установ та організацій, що належать до сфери управління Держкомтелерадіо і забезпечують формування та впровадження еталонних сигналів у програми телебачення та радіомовлення України;

7) структурні підрозділи підприємств, установ та організацій, що належать до сфери управління ДКА і забезпечують використання супутникових каналів зв’язку для передавання, прийому та контролю еталонних сигналів.